ГФСУ в листі від 25.08.2015 р. № 31376/7/99-99-15-01-04-17 роз'яснила, що штрафні санкції і пеня за порушення термінів для самостійної сплати податкових зобов'язань по ПДВ не застосовуються, якщо у платника в такі терміни є засоби на рахунках в СЭА НДС в сумах, достатніх для сплати ПДВ до бюджету або на спецрахунках сельхозпредприятий-спецрежимников.
При цьому ГФСУ відмітила, що у разі нарахування впродовж перехідного періоду СЭА ПДВ, тобто з 01.02.2015 р. по 01.07.2015 р., вказаних штрафних санкцій, вони підлягають списанню контролюючим органом по місцю реєстрації платника ПДВ впродовж 14 робочих днів.