Правительство во исполнение постановления Киевского апелляционного административного суда от 8 февраля 2016 года отменило решение относительно реорганизации Государственной санитарно-эпидемиологической службы путем ее присоединения к Государственной службе по вопросам безопасности пищевых продуктов и защиты потребителей.
Дальнейшее функционирование Госсанэпидслужбы нецелесообразно, поскольку на сегодняшний день выполнение ее функций обеспечивают Минздрав, Гоструда и Госпродпотребслужба.
Соответствующее решение о ликвидации Госсанэпидслужбы и образовании ликвидационной комиссии утверждено постановлением от 29.03.2017 г. № 348.