Миндоходов утверждает, что если сельскохозяйственный товаропроизводитель - субъект специального режима обложения НДС получает предоплату за сельскохозяйственную продукцию собственного производства, то на дату получения предоплаты (первое событие) он определяет налоговые обязательства по такой операции и выписывает налоговую накладную покупателю в общеустановленном порядке. В дальнейшем такая операция подлежит отражению в декларации по НДС с пометкой 0121, 0122 или 0123.
Авторы письма объяснили, что сельскохозяйственный режим обложения НДС не определяет отдельные правила налогообложения, а лишь устанавливает отдельный учет таких операций и порядок использования сумм НДС.
Определение налоговых обязательств, формирование налогового кредита, оформление, выписка и регистрация в ЕРНН налоговых накладных, а также представление отчетности по НДС сельхозпредприятиями осуществляются в общеустановленном порядке (письмо от 20.09.2013 г. № 18803/7/99-99-19-04-02-17).