ГНСУ відмітила, що у разі незгоди платника податків з виводами перевірки або фактами і даними, викладеними в акті (довідці) перевірки, він має право подати свої заперечення упродовж п'яти робочих днів з дня отримання акту (довідки). Такі заперечення розглядаються податковим органом впродовж п'яти робочих днів, що йдуть за днем їх отримання (днем завершення перевірки, проведеної у зв'язку з необхідністю з'ясування обставин, які не були досліджені під час перевірки і вказані в зауваженнях), і платникові податків вирушає відповідь в порядку, передбаченому для відправлення (вручення) податкових повідомлень-рішень.
Податкове повідомлення-рішення, зокрема, приймається керівником податкового органу (його заступником) :
- упродовж десяти робочих днів з дня, що йде за днем вручення платникові податків акту перевірки;
- за наявності заперечень платника податків до акту перевірки з урахуванням висновку про результати розгляду заперечень до акту перевірки - упродовж трьох робочих днів, що йдуть за днем розгляду заперечень і надання (відправлення) письмової відповіді платникові податків.
Тобто якщо відповідь на заперечення до акту перевірки отримана, то податкове повідомлення-рішення має бути прийняте впродовж трьох робочих днів, що йдуть за днем розгляду заперечень і надання (відправлення) такої письмової відповіді. При цьому слід відрізняти терміни прийняття податкового повідомлення-рішення від терміну його відправлення (вручення) платникові податків (лист від 22.05.2012 р. № 8770/6/10-1115/2106).