ГНСУ вважає, що платники екологічного податку, здійснюючі скидання, у водні об'єкти забруднюючих речовин, що виникають за результатами господарської діяльності, повинні отримати дозвіл на спеціальне водокористування.
У разі скидань відходів в системи зборів стічних вод підприємств, внаслідок чого утворюються забруднюючі речовини (водні суміші, водні розчини і т. д.), які надалі скидаються безпосередньо в створені такими підприємствами штучні водні об'єкти, при численні екологічного податку слід застосовувати ставки, визначені статтею 245 НКУ (наказ від 21.12.2012 р. № 1179).