ГНСУ наказом від 15.05.2012 р. № 420 затверджені Методичні рекомендації відносно комплексного відробітку сум ПДВ, що формують податковий кредит по податкових накладних, не зареєстрованих в ЕРНН.
Згідно з рекомендаціями податкові органи щомісячно не пізніше 28 чисел зіставляють дані по податковому кредиту з РНН, наданих платниками, і ЕРНН і формують переліки платників ПДВ, що включили до складу податкового кредиту незареєстровані податкові накладні.
Далі не пізніше 4 числа наступного місяця платникам ПДВ, що не подав за звітний місяць РНН або що має розбіжності між даними РНН і ЕРНН, з якими договір про визнання електронних документів :
- ув'язнений, через портал ГНСУ вирушають електронні повідомлення. Паперовий документ надається на вимогу платника упродовж 3 робочих днів;
- не ув'язнений, вирушають паперові повідомлення.